Le gouvernement du Bénin à travers le Ministère de la Santé a mis en place, un système de surveillance et de prise en charge des effets indésirables qui pourraient survenir à l’issue de la vaccination. En cas de survenue d’effets indésirables, les cas sont référés vers les centres hospitaliers sélectionnés et sont pris en charge. Par ailleurs, les agents de santé sur tous les sites de vaccinations ont été formés et équipés en vue de réagir rapidement aux cas éventuels d’effets secondaires.